蛋白酶抑制劑(protease inhibitor)從廣義上指與蛋白酶分子活性中心上的一些基團結合，使蛋白酶活力下降，甚至消失，但不使酶蛋白變性的物質。破碎細胞提取蛋白質的同時可釋放出蛋白酶，這些蛋白酶需要迅速的被抑制以保持蛋白質不被降解。在蛋白質提取過程中，需要加入蛋白酶抑制劑以防止蛋白水解。
| 抑制劑 |
靶點 |
機制 |
溶解度 |
工作濃度 |
| 抑肽酶 |
絲氨酸蛋白酶 |
可逆 |
10mg/mL(H20) |
100 to
200mM |
| B-甘油磷酸鈉 |
絲氨酸-蘇氨酸磷酸酶 |
可逆 |
10mg/mL(H20) |
1 to
100mM |
| 原釩酸鈉 |
酪氨酸和堿性磷酸酶 |
不可逆 |
20mg/mL(H20) |
1 to
100mM |
| 焦磷酸納 |
絲氨酸-蘇氨酸磷酸酶 |
不可逆 |
65mg/mL (H20) |
1 to
100mM |
| 氟化鈉 |
絲氨酸/蘇氨酸和酸性磷酸酶 |
不可逆 |
40mg/mL(H20) |
1 to
20mM |
| AEBSF·HC1 |
絲氨酸蛋白酶 |
不可逆 |
200mg/mL(H20) |
0.2 to
1.0mM |
| Bestatin |
氨肽酶 |
可逆 |
5mg/mL(Me0H) |
I to
10uM |
